近年來，昭通市堅持把水污染防治作為推動經濟社會可持續發展的突出任務，以貫徹落實河長制為抓手，深入實施《昭通市水污染防治實施方案》，進一步加大水資源保護、水環境治理、水生態修復工作力度，有效抑制水污染事故發生，多措并舉保障全市水環境安全。

昭通位于金沙江下游右岸和長江上游的云、貴、川3省結合部匯水區域，共有金沙江下游、長江上游干流和烏江3大水系，是長江上游的重要生態安全屏障。目前，全市共設置了29個地表水監測斷面，其中，國控斷面5個，省控斷面15個，市控斷面9個。2018年，全市地表水達標率為89.65%。

為補齊水資源保護短板，該市加大中心城市黑臭水體整治力度，對昭陽城區的利濟河、禿尾河、東門小河3條城市黑臭水體進行治理，其中利濟河工程治理已完成，基本消除了黑臭，并通過了國家住建部、環保部考核；禿尾河和東門小河工程整治措施已基本完成，正在開展掃尾工作。各縣區加大城鎮污水處理及配套管網建設，11座縣城污水處理廠已建成并投入運行，每日污水處理能力達到19.15萬噸。

針對工業水污染防治重點，該市采取集中治理方式對昭陽、魯甸、彝良、水富4個省級工業園區水污染治理情況開展專項檢查，督促昭陽工業園區完成集中式污水處理設施建設并安裝在線監測設備，同時加快推進加油站地下油罐雙層罐更新或防滲池設置工作。目前，魯甸、彝良、水富工業園區，采取依托城鎮污水處理廠和企業自建相結合的方式對污水進行處理，全市地下油罐防滲改造工作已完成76.35%。

此外，該市深入開展集中式飲用水水源地環境保護專項行動和農村環境綜合整治示范項目，從源頭上保障了全市水環境安全。先后開展了全市飲用水水源保護區劃分，督促水資源突出環境問題整改，全面完成縣級以上城鎮集中式飲用水水源環境狀況年度評估，積極爭取國家、省級環保專項資金開展農村環境綜合整治試點示范。

目前，全市已完成170個村莊的環境綜合整治，21個村莊環境整治項目正在加快推進，全市禁養區范圍內的5家規模養殖場和37家規模以下養殖場已作出搬遷或關閉處理。